Course detail
Bioinformatics and Databases
FCH-MC_BIDAcad. year: 2023/2024
Not applicable.
Language of instruction
Number of ECTS credits
Mode of study
Guarantor
Entry knowledge
Rules for evaluation and completion of the course
Aims
Study aids
Prerequisites and corequisites
Basic literature
Brown TA., Genomes 4, Garland Science, 2018 (CS)
Recommended reading
Elearning
Classification of course in study plans
- Programme NPCP_CHMA Master's
specialization CHBL , 2 year of study, winter semester, compulsory-optional
- Programme NPCP_PCHBT Master's 2 year of study, winter semester, compulsory-optional
Type of course unit
Lecture
Teacher / Lecturer
Syllabus
Osnova (týdenní výuka) :
1. Úvod do bioinformatiky
2. Základy molekulární biologie z pohledu informatiky
3. Nástroje molekulární biologie
4. Databáze biologických dat – EMBL, DBJ, GenBank, Swiss-Prot, TrEMBL
5. Zarovnání sekvencí, dynamického programování, BLAST, FASTA
6. Evoluční modely
7. Konstrukce fylogenetických stromů
8. Sestavování fragmentů DNA
9. Genomika a rozpoznávání genů
10. Proteiny a predikce jejich struktury
11. Výpočet sekundární struktury RNA
12. Proteomika, regulační sítě
13. Polymorfizmus genů a diverzita
Guided consultation in combined form of studies
Teacher / Lecturer
Elearning