Teorie přenosových jevů – aplikace teoretických aspektů na biologické systémy z hlediska dynamického, prostorového, fázového (suspenze, disperze a emulze) a reologického (různé typy tekutin); transportní analogie. Difúzní separační procesy, termodynamika – výpočet termodynamických funkcí ve složitých systémech s fázovými a chemickými přeměnami; fázové a chemické rovnováhy vícesložkových vícefázových systémů; termodynamické a transportní vlastnosti látek. Numerické metody v bioinženýrství.
Produkce proteinů v buňce a jejich izolace. Izolace bioaktivních látek pomocí nosičů s imobilizovanými afinitními ligandy. Speciální izolační postupy. Průmyslové chromatografické separační techniky. produkce. Základní operace spojené s kultivací mikroorganizmů (MO), sterilizací, izolací a extrakci produktů a MO, a dále pochopit koncept štruktúry proteínu a kinetiky enzýmových reakcí.