Seminář oboru II přímo navazuje na Seminář oboru I a je jeho pokračováním v dalším semestru, tudíž aktivity budou podobné. Předmět je koncipován jako interaktivní kurz s komunikační složkou a důrazem na samostatnou práci, na rozvíjení individuálních výzkumných a prezentačních dovedností při řešení konkrétního problému z oblasti medicínských systémů a materiálů. Seminář bude mít několik součástí: část časové kapacity bude věnována výběrovým přednáškám, kde budou zváni význační odborníci z průmyslové praxe, spolupracujících pracovišť a institucí, aby byly studentům rozšířeny poznatky a informace z oboru, blíže propojena vědecká a školská komunita s odbornou praxí a navázány přímé kontakty ohledně uplatnění absolventů. Další část bude věnována prezentacím specializovaných částí výzkumných programů jednotlivých laboratoří CMV a FCH studenty doktorského studia. Semináře budou realizovány otevřenou formou a budou na ně zváni i kolegové a studenti z příbuzných oborů.